Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QRE1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QRE1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QRE1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QRE1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QRE1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QRE1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QRE1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QRE1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms