Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN34H7C241 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms