Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms