Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC10BA6NIK2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms