Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIT2A6NDA9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIT2A6NDA9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms