Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA1A5PL33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA1A5PL33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 547.2 ms