Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB5A4FU69 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB5A4FU69 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms