Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F8A0AVK6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms