Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J269

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J269 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0B4J269 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0B4J269 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0B4J269 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0B4J269 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0B4J269 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0B4J269 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J269 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms