Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYH0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYH0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYH0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYH0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYH0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
V9GYH0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYH0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYH0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms