Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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