Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms