Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4CQ9UP65 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4CQ9UP65 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms