Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5BQ9UGL1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms