Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms