Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms