Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms