Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATAD3AQ9NVI7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATAD3AQ9NVI7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms