Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD4Q9NVD3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms