Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms