Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3GQ9NS98 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms