Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHK2Q9NRA0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms