Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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ARHGEF4Q9NR80 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF4Q9NR80 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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