Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP2Q9NPB3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP2Q9NPB3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms