Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC17Q9NP64 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms