Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms