Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms