Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF1Q9H9Y2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPF1Q9H9Y2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms