Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRDE2Q9H7Z3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms