Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms