Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf49Q9H6J7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms