Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM60Q9H2L4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM60Q9H2L4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM60Q9H2L4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM60Q9H2L4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM60Q9H2L4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM60Q9H2L4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms