Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms