Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms