Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms