Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms