Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf70Q9BSU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf70Q9BSU1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms