Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms