Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EYA3Q99504 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EYA3Q99504 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms