Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UIMC1Q96RL1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms