Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A9Q96Q91 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms