Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP2Q96PD5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGLYRP2Q96PD5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms