Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP53Q96M91 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms