Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms