Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX11Q96FC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX11Q96FC9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms