Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms