Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms