Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC102AQ96A19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC102AQ96A19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms