Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms