Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4DQ92854 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms